MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halobacteroides halobius DSM 5150

Total Repeats: 63290

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019978	ATA	2	6	426	431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	435852813
2	NC_019978	TCT	2	6	433	438	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	435852813
3	NC_019978	AAG	2	6	501	506	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	435852813
4	NC_019978	TAAC	2	8	519	526	50 %	25 %	0 %	25 %	435852813
5	NC_019978	TGAAA	2	10	556	565	60 %	20 %	20 %	0 %	435852813
6	NC_019978	GAA	3	9	566	574	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	435852813
7	NC_019978	A	8	8	585	592	100 %	0 %	0 %	0 %	435852813
8	NC_019978	CAA	2	6	623	628	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	435852813
9	NC_019978	GAG	2	6	629	634	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	435852813
10	NC_019978	CCT	2	6	647	652	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	435852813
11	NC_019978	GTA	3	9	693	701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	435852813
12	NC_019978	TGC	2	6	715	720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	435852813
13	NC_019978	TAGCAG	2	12	726	737	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	435852813
14	NC_019978	ATGC	2	8	806	813	25 %	25 %	25 %	25 %	435852813
15	NC_019978	TA	3	6	824	829	50 %	50 %	0 %	0 %	435852813
16	NC_019978	ATTA	2	8	889	896	50 %	50 %	0 %	0 %	435852813
17	NC_019978	GAT	2	6	908	913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	435852813
18	NC_019978	TTA	2	6	956	961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	435852813
19	NC_019978	AAAG	2	8	989	996	75 %	0 %	25 %	0 %	435852813
20	NC_019978	AAG	2	6	1002	1007	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	435852813
21	NC_019978	ATG	2	6	1035	1040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	435852813
22	NC_019978	AACA	2	8	1043	1050	75 %	0 %	0 %	25 %	435852813
23	NC_019978	ATT	3	9	1052	1060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	435852813
24	NC_019978	CCA	2	6	1073	1078	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	435852813
25	NC_019978	AGA	2	6	1096	1101	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	435852813
26	NC_019978	A	6	6	1184	1189	100 %	0 %	0 %	0 %	435852813
27	NC_019978	GCT	2	6	1190	1195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	435852813
28	NC_019978	AAATA	2	10	1240	1249	80 %	20 %	0 %	0 %	435852813
29	NC_019978	AAT	2	6	1288	1293	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	435852813
30	NC_019978	GGAA	2	8	1387	1394	50 %	0 %	50 %	0 %	435852813
31	NC_019978	TAG	2	6	1425	1430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	435852813
32	NC_019978	A	6	6	1455	1460	100 %	0 %	0 %	0 %	435852813
33	NC_019978	TCTT	2	8	1537	1544	0 %	75 %	0 %	25 %	435852813
34	NC_019978	GGCG	2	8	1568	1575	0 %	0 %	75 %	25 %	435852813
35	NC_019978	ATAAA	2	10	1605	1614	80 %	20 %	0 %	0 %	435852813
36	NC_019978	A	6	6	1612	1617	100 %	0 %	0 %	0 %	435852813
37	NC_019978	A	7	7	1644	1650	100 %	0 %	0 %	0 %	435852813
38	NC_019978	A	6	6	1668	1673	100 %	0 %	0 %	0 %	435852813
39	NC_019978	TCAA	2	8	1983	1990	50 %	25 %	0 %	25 %	435852814
40	NC_019978	A	6	6	2021	2026	100 %	0 %	0 %	0 %	435852814
41	NC_019978	AAC	2	6	2041	2046	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	435852814
42	NC_019978	TTG	2	6	2136	2141	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	435852814
43	NC_019978	TAC	2	6	2152	2157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	435852814
44	NC_019978	TAT	2	6	2197	2202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	435852814
45	NC_019978	TAA	2	6	2248	2253	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	435852814
46	NC_019978	GCA	2	6	2303	2308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435852814
47	NC_019978	TTA	2	6	2321	2326	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	435852814
48	NC_019978	A	6	6	2374	2379	100 %	0 %	0 %	0 %	435852814
49	NC_019978	ATT	2	6	2381	2386	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	435852814
50	NC_019978	AGA	2	6	2410	2415	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	435852814
51	NC_019978	AAAC	2	8	2419	2426	75 %	0 %	0 %	25 %	435852814
52	NC_019978	GGA	2	6	2438	2443	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	435852814
53	NC_019978	AGA	2	6	2509	2514	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	435852814
54	NC_019978	TAT	2	6	2551	2556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	435852814
55	NC_019978	CAG	2	6	2601	2606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435852814
56	NC_019978	TTTA	2	8	2641	2648	25 %	75 %	0 %	0 %	435852814
57	NC_019978	CAA	2	6	2705	2710	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	435852814
58	NC_019978	CCAAA	2	10	2717	2726	60 %	0 %	0 %	40 %	435852814
59	NC_019978	GCAA	2	8	2764	2771	50 %	0 %	25 %	25 %	435852814
60	NC_019978	AGC	2	6	2779	2784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435852814
61	NC_019978	TTA	2	6	2786	2791	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	435852814
62	NC_019978	A	6	6	2795	2800	100 %	0 %	0 %	0 %	435852814
63	NC_019978	ATA	2	6	2810	2815	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	435852814
64	NC_019978	GAA	2	6	2882	2887	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	435852814
65	NC_019978	GATA	2	8	2962	2969	50 %	25 %	25 %	0 %	435852814
66	NC_019978	TTA	2	6	3015	3020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	435852814
67	NC_019978	AT	3	6	3040	3045	50 %	50 %	0 %	0 %	435852814
68	NC_019978	AAG	2	6	3064	3069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	435852814
69	NC_019978	AGG	2	6	3076	3081	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	435852814
70	NC_019978	TAT	2	6	3084	3089	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	435852815
71	NC_019978	A	7	7	3091	3097	100 %	0 %	0 %	0 %	435852815
72	NC_019978	GGA	2	6	3163	3168	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	435852815
73	NC_019978	ATT	2	6	3181	3186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	435852815
74	NC_019978	GTG	2	6	3248	3253	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	435852815
75	NC_019978	GGA	2	6	3268	3273	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	435852815
76	NC_019978	CTT	3	9	3290	3298	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	435852815
77	NC_019978	TAAA	2	8	3337	3344	75 %	25 %	0 %	0 %	435852816
78	NC_019978	ACA	2	6	3359	3364	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	435852816
79	NC_019978	ATTT	2	8	3391	3398	25 %	75 %	0 %	0 %	435852816
80	NC_019978	TTC	2	6	3461	3466	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	435852816
81	NC_019978	AGTT	2	8	3566	3573	25 %	50 %	25 %	0 %	435852816
82	NC_019978	AAG	2	6	3589	3594	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	435852816
83	NC_019978	TAA	2	6	3608	3613	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	435852816
84	NC_019978	T	6	6	3658	3663	0 %	100 %	0 %	0 %	435852816
85	NC_019978	ATTA	2	8	3680	3687	50 %	50 %	0 %	0 %	435852816
86	NC_019978	AAG	2	6	3704	3709	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	435852816
87	NC_019978	TAT	2	6	3747	3752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	435852816
88	NC_019978	AAT	2	6	3795	3800	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	435852816
89	NC_019978	GCA	2	6	3834	3839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435852816
90	NC_019978	AATT	2	8	3916	3923	50 %	50 %	0 %	0 %	435852816
91	NC_019978	AAC	2	6	3940	3945	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	435852816
92	NC_019978	TGG	2	6	3956	3961	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	435852816
93	NC_019978	TAA	2	6	4027	4032	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	435852816
94	NC_019978	A	7	7	4031	4037	100 %	0 %	0 %	0 %	435852816
95	NC_019978	ACAGCA	2	12	4058	4069	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	435852816
96	NC_019978	GAT	2	6	4113	4118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	435852816
97	NC_019978	AAT	2	6	4134	4139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	435852816
98	NC_019978	CAA	2	6	4170	4175	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	435852816
99	NC_019978	AAC	2	6	4178	4183	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	435852816
100	NC_019978	AGCTTT	2	12	4184	4195	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	435852816
101	NC_019978	AGAATT	2	12	4205	4216	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	435852816
102	NC_019978	TTA	2	6	4248	4253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	435852816
103	NC_019978	GAT	2	6	4257	4262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	435852816
104	NC_019978	T	6	6	4264	4269	0 %	100 %	0 %	0 %	435852816
105	NC_019978	ATA	2	6	4279	4284	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	435852816
106	NC_019978	TTA	2	6	4333	4338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	435852816
107	NC_019978	AG	3	6	4353	4358	50 %	0 %	50 %	0 %	435852816
108	NC_019978	TA	3	6	4396	4401	50 %	50 %	0 %	0 %	435852816
109	NC_019978	AAC	2	6	4407	4412	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	435852816
110	NC_019978	A	7	7	4450	4456	100 %	0 %	0 %	0 %	435852817
111	NC_019978	GAT	2	6	4463	4468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	435852817
112	NC_019978	AGA	2	6	4504	4509	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	435852817
113	NC_019978	TAT	2	6	4590	4595	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	435852817
114	NC_019978	ATT	3	9	4630	4638	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	435852817
115	NC_019978	ATCA	2	8	4664	4671	50 %	25 %	0 %	25 %	435852817
116	NC_019978	A	6	6	4671	4676	100 %	0 %	0 %	0 %	435852817
117	NC_019978	TAAA	2	8	4722	4729	75 %	25 %	0 %	0 %	435852817
118	NC_019978	AGA	2	6	4765	4770	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	435852817
119	NC_019978	TAAA	2	8	4794	4801	75 %	25 %	0 %	0 %	435852817
120	NC_019978	A	7	7	4882	4888	100 %	0 %	0 %	0 %	435852817
121	NC_019978	AGA	2	6	4893	4898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	435852817
122	NC_019978	TC	3	6	4938	4943	0 %	50 %	0 %	50 %	435852817
123	NC_019978	A	6	6	4980	4985	100 %	0 %	0 %	0 %	435852817
124	NC_019978	AAG	2	6	4998	5003	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	435852817
125	NC_019978	TTA	2	6	5012	5017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	435852817
126	NC_019978	AGC	2	6	5021	5026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435852817
127	NC_019978	GAT	2	6	5078	5083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	435852817
128	NC_019978	GAA	2	6	5111	5116	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	435852817
129	NC_019978	CAA	2	6	5171	5176	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	435852817
130	NC_019978	TAA	2	6	5250	5255	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	435852817
131	NC_019978	A	8	8	5254	5261	100 %	0 %	0 %	0 %	435852817
132	NC_019978	CAA	2	6	5407	5412	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	435852818
133	NC_019978	AGA	2	6	5450	5455	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	435852818
134	NC_019978	ATT	2	6	5473	5478	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	435852818
135	NC_019978	GAA	2	6	5511	5516	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	435852818
136	NC_019978	TAT	2	6	5523	5528	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	435852818
137	NC_019978	TCT	2	6	5538	5543	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	435852818
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